普段、ImageJで使用しているtime-lapse imageなどのmulti-tiff画像をMatlab上で一括処理したいのだけど、Matlabではmulti-tiffをコマンド一発で開くことができない？みたい。ググッたらループを回して一枚ずつ読み込むようなスクリプトが紹介されていたりす…

＊2017/06/05 追記＊突然、Matlab上でMijiが起動しなくなった。 調べてみたところ、Fiji.app/jars内にあるはずのmijのjarファイルがアップデートの過程で消えてしまった模様。 復旧するには、Update...でImageJ Updaterを開き、Manage update sitesでBIG-EPF…

Olympus FV1000で取得したoibファイルなどをFiji/ImageJのBio-Formatsプラグインを使って一括でtiffファイルに変換するJython script Jython scriptでのBio-Formatsの使い方は以下のページを参照Jython example script for working with the Bio-Formats API…

Mavericksへのアップデートに併せてmacportsを再インストール。まず既存のmacportsをアンインストール。sudo port -f uninstall installedしてからrm -rf /opt/local 次にxcodeのコマンドラインツールをインストール（xcode自体はインストール済み）。xcode-…

KUINS-III内部でmacportsを使う方法。svnを使う方法は良く紹介されてるけどもっと簡単にできた。selfupdateは、sudo RSYNC_PROXY=(プロキシサーバーのアドレス):(ポート番号) port -d selfupdateで通る。サーバーのアドレスはpから始まるあれ。installまたは…

Macでopencvを使えるようにするまでのいろいろを備忘録代わりに。 正しいかどうかはあんまり自信ないので。 環境： MacOS 10.7 (Lion) Macports (2.1.2) python (2.7.3), Numpy (1.6.2) < Macportsでinstall Macportsでopencvをinstall。pythonからopencvを…